了解水生态监测之前，首先要明白什么是水生态系统？水生态系统由水生生物群落以及影响其生长繁殖的非生物环境组成，系统间各要素通过物质循环、能量流动和信息传递等过程，达到动态平衡。而水生态监测，就是对水生态系统开展的监测工作。

围绕“水生态系统”，监测指标就包含在“水生境”“水环境”和“水资源”三方面中。监测指标一般包括水生生物、水生境和影响生物生长繁殖的理化因子。

理化因子就是常说的水质理化指标，“水质理化指标包括影响水生生物生长繁殖的水温、pH、溶解氧、电导率、浊度、高锰酸盐指数、氨氮、总磷和总氮等，湖库点位增测透明度和叶绿素A。”

水生生物监测的必测指标一般包括浮游植物、浮游动物、大型底栖无脊椎动物、着生藻类、大型水生植物等，鱼类、生物体残毒、环境DNA、稳定同位素等暂定为选测指标。

水生境监测指标包括岸带、栖息地和水源涵养区的人类活动、植被覆盖、形态特征等情况，以及水体的水量、流速等水文情

水生态监测指标的确定，主要考虑了5个方面：

第一，以管理为导向，根据水生态保护管理需求，坚持问题导向、目标导向、结果导向，监测指标覆盖各类人类活动对水生态系统的影响。

第二，科学合理，综合考虑水生态系统的整体性，从生态系统的结构和功能出发，科学设置监测指标，综合反映水生态系统的质量和稳定性。

第三，立足实际，从当前水生态监测能力现状出发，将管理亟需、监测方法成熟、监测能力能够支撑的项目纳入必测指标，其他指标暂列为选测项目，稳步发展。

第四，因地制宜，根据河流、湖泊、水库等不同水体类型，以及不同流域的水生态系统特点，设置框架统一、特色鲜明的监测指标。如大型底栖无脊椎动物监测，适合于河流和浅水湖泊，对于水库等水位变化剧烈的水体或深水湖库等较深的水体，则不适宜开展监测。

最后，与国际接轨，充分调研欧美等国家水生态环境状况评估项目监测指标，确定水生态监测的指标框架和内容。

提到监测指标，很多人脑海里第一反应是固定不变的，例如水质理化指标。那么，水生态所涉及到的监测指标都是一成不变的吗？答案并非如此。

目前的监测指标是在现有监测能力基础上确定的，未来随着监测能力的不断提升，监测指标体系会逐渐健全。例如，原部分流域由于监测能力限制，不具备开展着生藻类监测的条件，目前，着生藻类已作为监测指标的必选内容之一。

而随着管理需求的不断扩大，水生态监测的指标也在逐步增加。“2020年重点流域水生态监测工作，生境监测指标仅包括现场生境调查，随着流域水生态保护管理工作的不断深化，增加了水源涵养区生态系统质量、水生生物栖息地人类活动等指标。”

当前，部分重点湖泊水华加剧，水生态系统失衡，已成为美丽中国建设的突出短板，这对水生态监测工作也提出了新的更高要求。“未来，随着监测技术的发展，越来越多的监测指标会被纳入试点监测范围。比如水华预警监测、基于环境DNA的水生生物多样性监测、基于高光谱等技术的中小尺度生境监测等。”